Los inmunoensayos fluorescentes son un tipo diferente de inmunoensayo. La variable clave es la técnica bioquímica utilizada para detectar la unión del anticuerpo de detección y la molécula del analito. Las ventajas de un sistema de detección fluorescente se conocen desde hace muchos años. Estos incluyen una detección de mayor sensibilidad del analito, reactivos simplificados y diseños de ensayo más simples. Se han producido varios avances en los últimos años que han permitido la implementación de un sistema de inmunoensayo basado en fluorescentes en el punto de atención.

Un inmunoensayo moderno basado en fluorescencia utiliza como reactivo de detección un compuesto fluorescente que absorbe luz o energía (energía de excitación) en una longitud de onda específica y luego emite luz o energía en una longitud de onda diferente. La diferencia entre la longitud de onda de la luz de excitación y la luz de emisión se denomina desplazamiento de Stokes. Cuanto mayor sea el cambio o la diferencia en la longitud de onda, menos interferencia habrá al detectar la luz de excitación como parte de la luz de emisión. Recientemente se han producido una serie de mejoras técnicas que han permitido la implementación de un sistema de inmunoensayo de alta sensibilidad. Estos incluyen la disponibilidad de fuentes de luz de bajo costo de longitud de onda estrecha, fluoróforos más nuevos y estables que tienen cambios de Stokes muy amplios, detectores de luz de estado sólido estables y microprocesadores para procesar y analizar los datos de cada prueba.